Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms