Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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