Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRIM8Q9BZR9 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRIM8Q9BZR9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRIM8Q9BZR9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRIM8Q9BZR9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRIM8Q9BZR9 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRIM8Q9BZR9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM8Q9BZR9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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