Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms