Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms