Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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