Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN4Q92575 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms