Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms