Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM139Q8IV31 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms