Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms