Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms