Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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