Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IHHQ14623 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IHHQ14623 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IHHQ14623 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IHHQ14623 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IHHQ14623 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms