Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms