Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms