Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CACNA1BQ00975 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms