Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms