Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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HOXD10P28358 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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HOXD10P28358 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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HOXD10P28358 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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HOXD10P28358 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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HOXD10P28358 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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HOXD10P28358 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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HOXD10P28358 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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