Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCP2P22307 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCP2P22307 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCP2P22307 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCP2P22307 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms