Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms