Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms