Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms