Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTBP09497 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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