Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYBBP04839 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYBBP04839 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms