Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms