Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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