Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5BQ9UGL1 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms