Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
XCL2Q9UBD3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms