Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
COG4Q9H9E3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms