Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC3Q9BY71 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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