Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms