Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM2Q9BVW6 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms