Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCMBPQ9BTE3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms