Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms