Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms