Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIC2Q96JB3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms