Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SPTSSAQ969W0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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