Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms