Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD2Q969F2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms