Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms