Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG3Q8WXD2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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