Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms