Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HTR3B-201ENST00000260191 2011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 UGT1A7-201ENST00000373426 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms