Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A3Q5K4L6 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms