Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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