Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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NRF1Q16656 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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NRF1Q16656 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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