Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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VPS72Q15906 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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VPS72Q15906 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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VPS72Q15906 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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VPS72Q15906 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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VPS72Q15906 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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