Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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