Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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