Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGEF6Q15052 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms